На сьогодні, до основних завдань та функцій митних органів належить забезпечення реалізації політики у сфері державної митної справи та боротьби з правопорушеннями під час застосування митного законодавства; здійснення в межах свої повноважень контролю за надходженням до бюджетів та державних цільових фондів податків і зборів, митних та інших платежів; безпосереднє здійснення митної справи, контроль за додержанням усіма юридичними й фізичними особами законодавства України з питань митної справи; ужиття заходів до захисту інтересів споживачів товарів, недопущення ввезення на територію України та випуску у вільний обіг неякісних товарів; створення сприятливих умов для прискорення товарообігу, збільшення обсягів вантажопотоку через митний кордон України та захисту прав інтелектуальної власності юридичних і фізичний осіб у процесі здійснення зовнішньоекономічної діяльності; спрощення митних процедур шляхом подальшого використання «єдиного вікна», інституту уповноваженого економічного оператора, розвитку системи управління ризиками.
Митний контроль, як одне з важливих завдань митних органів, є вагомим засобом, що сприяє формуванню та реалізації митної політики держави.